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We need you! Our team has always open positions for talented and highly motivated students.
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We accept all applications: from undergraduate students (e.g. 6 months Master fellowships) to PhD applications to take a 3-year exciting journey in one of our upcoming research projects at the frontiers of chemistry and biology.
We also welcome post-doctoral students, especially those interested in preparing applications for European grants such as Marie Curie or willing to apply for a permanent researcher position in our team.
Openings
Période : 6 mois à partir de janvier/février 2025 jusqu’à juin/juillet 2025
Contact : gilles.subra@umontpellier.fr ; ahmad.mehdi@umontpellier.fr
Localisation : IBMM, Pôle Chimie Balard, Montpellier, équipe Peptides www.ibmmpeptide.com et ICGM, Pôle Chimie Balard, Montpellier, équipe www.icgm.fr/linstitut/les-departements/d3
Les travaux se déroulement principalement à l’IBMM et à l’ICGM à Montpellier, avec des déplacements prévus au CTC à Lyon
Résumé :
Le sujet, inscrit dans le cadre de la Chaire Industrielle SICLE.e en collaboration avec le Centre Technique du Cuir à Lyon, a permis le développement d’une méthode de tannage innovante et de rupture. Plus respectueuse de l’environnement et de la santé, en harmonie avec la préservation de l’environnement et le bien-être des individus, cette technologie s’appuie sur l’utilisation du silicium via le procédé sol-gel.
La qualité et les propriétés macroscopiques des cuirs (résistance à la chaleur, souplesse, homogénéité de surface) sont directement liées à la réactivité de l’agent tannant à l’échelle moléculaire. L’objectif de ce stage est d’identifier et comprendre l’influence de paramètres clés du procédé sol-gel sur la réticulation des fibres de collagène, afin de comprendre et améliorer l’influence du tannage sur l’esthétique de surface des cuirs. Pour ce faire, un réacteur modèle sera développé, nous permettant d’étudier les différents paramètres opératoires (concentration, pH, température, durée, nature des précurseurs tannants, etc.) et d’identifier les paramètres critiques influant sur l’esthétique de surface. En fonction de l’avancement du stage, une étude de l’interaction et de la réactivité entre les fibres de collagène et l’agent tannant pourra être réalisée, afin d’élucider le mécanisme de tannage. Cette étude plus fondamentale s’appuiera sur des technologies telles que la RMN ou la chromatographie.
Travail de l’étudiant(e)
L’étudiant(e) développera le réacteur et aura la charge de l’étude des différents paramètres clés. Il ou elle réalisera les analyses des cuirs obtenus (MEB, ATG, dosage, etc.).
Compétences acquises
- Gestion de projet académique/privé
- Procédé sol-gel
- Caractérisations physico chimiques des matériaux (MEB, Dosage silicium)
- Caractérisation chimique (RMN, chromatographie, etc.)
Compétences requises et savoir-être
- Anglais scientifique et chimie analytique niveau Master
- Une connaissance de la chimie organique, en particulier la chimie sol-gel serait un plus
- Autonomie, curiosité scientifique, rigueur
- Bon relationnel, capacité de rendre compte
Période : 6 mois à partir de janvier/février 2025 jusqu’à juin/juillet 2025
Contact : gilles.subra@umontpellier.fr ; ahmad.mehdi@umontpellier.fr
Localisation : IBMM, Pôle Chimie Balard, Montpellier, équipe Peptides www.ibmmpeptide.com et ICGM, Pôle Chimie Balard, Montpellier, équipe www.icgm.fr/linstitut/les-departements/d3
Les travaux se déroulement principalement à l’IBMM et à l’ICGM à Montpellier, avec des déplacements prévus au CTC à Lyon
Résumé
Le sujet s’inscrit dans le cadre de la Chaire Industrielle SICLE.e en collaboration avec le Centre Technique du Cuir à Lyon. Le cuir est un matériau naturel issu de la valorisation de l’industrie alimentaire. Il est composé de nombreuses protéines telles que le collagène, elles-mêmes valorisables. De sa fabrication jusqu’à son utilisation, le cuir génère des déchets à base de collagène : dérayures (copeaux de cuirs issus de la mise à l’épaisseur), chutes de cuir lors de la fabrication d’articles de maroquineries, articles en cuir en fin de vie, etc. Ces déchets peuvent être éliminés par incinération ou enfouissement, ou bien valorisés. Une des voies de valorisation à l’étude consiste à détanner les cuirs, puis séparer les protéines (hydrolysat) de l’agent tannant dans le but de les valoriser.
Ce stage a pour but d’étudier les caractéristiques des protéines extraites lors du procédé de détannage, ainsi que d’évaluer leur potentiel pour des usages industriels (agriculture, agro-alimentaire, cosmétique, etc.).
Travail de l’étudiant(e)
Pour réaliser ce travail, l’étudiant(e) devra mobiliser des compétences en chimie analytique et physicochimie des matériaux. Il ou elle aura pour mission de caractériser chimiquement la composition de l’hydrolysat de détannage : type de protéines présentes, caractérisation chimique de leur composition et de leur structure, traces de contaminant organiques (polymères) ou inorganiques (métaux ou oxydes métalliques) provenant du process de fabrication du cuir. Des comparaisons avec des matrices protéiques commerciales seront réalisées (caractéristiques physico-chimiques, tests de toxicité, etc.)
Afin de mener à bien ses missions, l’étudiant(e) s’appuiera sur toutes les techniques d’analyses chimiques (RMN, électrophorèse capillaire, dichroïsme circulaire, chromatographies, etc.) et physico-mécaniques (IR, ATG, MEB, rhéomètre, etc.) disponibles aux laboratoires de recherche.
L’étude des voies de valorisation de ces protéines dans différents secteurs industriels sera menée en partenariat avec le CTC, en prenant en considération les enjeux économiques et légaux.
Compétences acquises
- Gestion de projet académique/privé
- Caractérisation chimiques et physico chimiques des protéines
- Toxicologie des protéines
- Méthodologie de valorisation industrielle
Compétences requises et savoir-être
- Anglais scientifique et chimie analytique niveau Master
- Une connaissance de la chimie organique serait un plus
- Autonomie, curiosité scientifique, rigueur
- Bon relationnel, capacité de rendre compte
Période : 6 mois à partir de janvier/février 2025 jusqu’à juin/juillet 2025
Contact : ahmad.mehdi@umontpellier.fr ; gilles.subra@umontpellier.fr
Localisation : ICGM, Pôle Chimie Balard, Montpellier, équipe www.icgm.fr/linstitut/les-departements/d3 et IBMM, Pôle Chimie Balard, Montpellier, équipe Peptides www.ibmmpeptide.com
Les travaux se déroulement principalement à l’IBMM et à l’ICGM à Montpellier, avec des déplacements prévus au CTC à Lyon
Résumé
Le sujet s’inscrit dans le cadre de la Chaire Industrielle SICLE.e en collaboration avec le Centre Technique du Cuir à Lyon. Le but de ce projet est de valoriser des sous-produits de cuir obtenu après tannage : les dérayures. Ces dernières sont obtenues lors de la mise à l’épaisseur d’un cuir, par ponçage du cuir sur le côté chair. Elles se présentent sous la forme d’une poudre très grossière et sont généralement enfouies ou incinérées en industrie. Dans le cadre de ce projet, nous souhaitons élaborer des composites à base de ces dérayures, à partir d’une matrice polymérisable. Pour ce faire, des résines biosourcées réticulables par thermoformage ou des briques silylées polymérisables par sol-gel à basse température seront utilisées.
Des tests mécaniques (traction, torsion, fatigue, rupture…), des analyses thermiques (ATG, DSC) et des tests de stabilité chimique seront menés pour comprendre la réticulation pendant la fabrication et étudier les caractéristiques des composites finis. Cette étude permettra d’ajuster les conditions de thermoformage, le rapport matrice liant/cuir mais également de délimiter les domaines de température d’utilisation.
Travail de l’étudiant(e)
L’étudiant(e) sera dans un premier temps chargé(e) de la sélection des résines biosourcées et des briques silylées (étude bibliographique) et de la mise au point des conditions de polymérisation des composés sélectionnées en présence de dérayures. Dans un second temps, la conception sous différentes formes et la caractérisation de ces nouveaux matériaux composites seront réalisées.
Compétences acquises
- Gestion de projet académique/privé
- Chimie des polymères
- Matériaux composites
- Caractérisations physico chimiques et mécaniques usuelles des matériaux
Compétences requises et savoir-être
- Anglais scientifique, chimie et analyses des matériaux niveau Master
- Une bonne connaissance de la chimie des matériaux organiques serait un plus
- Autonomie, curiosité scientifique, rigueur
- Bon relationnel, capacité de rendre compte
Les PROTACs constituent une innovation majeure dans la conception d’agents thérapeutiques. Ces molécules constituées de deux ligands : l’un ciblant une protéine d’intérêt à dégrader, l’autre une ubiquitine E3 ligase (Ub-E3). Elles permettent de détourner le protéasome afin de dégrader spécifiquement une protéine impliquée dans un processus pathologique. Cependant, la conception et le développement de PROTACs restent fastidieux. Notre projet a pour objectif de lever ce verrou en créant le concept de poly-PROTAC. Il s’agira de générer des polymères fonctionnels présentant de multiples copies de molécules PROTAC et ainsi de permettre le multi-recrutement de protéines d’intérêt à dégrader et d’Ub-E3 ligases.
L’étudiant recruté sur ce projet sera impliqué depuis la synthèse et la caractérisation des ligands d’Ub-E3 ligase et de la protéine protéine d’intêret ainsi que dans leur formulation polymérique. La préparation et la caractérisation des polymères ‘polyPROTACs’ sera également au centre des investigations. Enfin, les évaluations biologiques, et notamment l’aptitude des polyPROTACs à dégrader la protéine d’intérêt, seront externalisés.
Domaines : chimie organique de synthèse ; synthèse sur support solide ; chimie des polymères.
Durée du stage : 6 mois, à partir de fin janvier.
Publication date : 10 Octobre 2024
Candidate before 10 December 2024
Project context:
Acute myeloid leukemias (AML) are associated with a poor prognosis and their resistance to
treatments necessitates new therapeutic modalities. Having identified a novel target in AML, we propose the design of original molecules acting as protein degraders (PROTACs) of this target, and capable of circumventing the resistances phenomena that are classically observed in these pathologies. PROTACs are heterodimeric compounds displaying two ligands connected through a linker. One is a ligand for a protein of interest (POI) that is to be degraded, and the other one for an ubiquitin-E3 ligase (Ub-E3). PROTACs enable the hijacking of the ubiquitin-proteasome system to degrade a protein involved in a pathological process. To be fully functional, it must allow the recruitment of POIs and Ub-E3 in a finely controlled spatial arrangement. Therefore, a library of PROTAC emcompassing the use of multiple linkers of different lengths and compositions will be prepared and our biologist collaborator in the Institut de recherche St Louis (Paris) will evaluate them. In addition to the optimization of the linker, different E3 ligase ligand will be surveyed. Altogether a collection of 40-60 compounds will be synthesized and the best performing compound will be further optimized in terms of efficacy, physicochemical properties and if possible pharmacokinetic parameters.
Expected outcome:
We envision the discovery of 2-3 effective PROTACs which should exhibit stronger antileukemic effect compared with the parental inhibitor – this is foreseen as the suppression of the scaffolding function of the protein, in addition to its catalytic activity, should ensure a complete blockade of its biochemical pathway. The synthesized compounds will be protected by a patent application before seeking further valorization opportunities.
Applications:
Send application by email at anthony.martin@umontpellier.fr including a cover letter and a CV. You can find the description of the job (fiche de poste) as attachement to this publication.
